Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm20918J3QN17 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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