Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Zfp616J3QN14 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Zfp616J3QN14 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.3 ms