Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cldn34c3J3QJW5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn34c3J3QJW5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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