Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Vmn1r67G5E8C1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Vmn1r67G5E8C1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms