Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms