Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SmgcF6VRN1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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