Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC051665E9Q623 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC051665E9Q623 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms