Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gm20518E9Q548 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gm20518E9Q548 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Gm20518E9Q548 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Gm20518E9Q548 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20518E9Q548 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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