Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc175E9PVB3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc175E9PVB3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms