Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf217D3YYI7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf217D3YYI7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf217D3YYI7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf217D3YYI7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Rnf217D3YYI7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rnf217D3YYI7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rnf217D3YYI7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Rnf217D3YYI7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rnf217D3YYI7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms