Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SafbD3YXK2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms