Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Samd1D3YXK1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Samd1D3YXK1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Samd1D3YXK1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Samd1D3YXK1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Samd1D3YXK1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd1D3YXK1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Samd1D3YXK1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Samd1D3YXK1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samd1D3YXK1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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