Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Usf3B2RUQ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms