Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb8B1AY40 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms