Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Odf2A3KGV1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms