Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp8b5A3FIN4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms