Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scn3aA2ASI5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Scn3aA2ASI5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scn3aA2ASI5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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