Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc183A2AJB1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms