Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pramel3A2AHA7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pramel3A2AHA7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms