Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc163A2AGD7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc163A2AGD7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms