Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Frmpd4A2AFR3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Frmpd4A2AFR3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms