Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms