Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc194A0A140LIT1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc194A0A140LIT1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc194A0A140LIT1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc194A0A140LIT1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc194A0A140LIT1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc194A0A140LIT1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc194A0A140LIT1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ccdc194A0A140LIT1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc194A0A140LIT1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc194A0A140LIT1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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