Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Homer1Q9Z2Y3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms