Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms