Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pdpk1Q9Z2A0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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