Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn8Q9Z260 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms