Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms