Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sumo3Q9Z172 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Sumo3Q9Z172 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Sumo3Q9Z172 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sumo3Q9Z172 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sumo3Q9Z172 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sumo3Q9Z172 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sumo3Q9Z172 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sumo3Q9Z172 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms