Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamc3Q9R0B6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms