Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prkab1Q9R078 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms