Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Col4a4Q9QZR9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a4Q9QZR9 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms