Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ripk3Q9QZL0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ripk3Q9QZL0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms