Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ercc4Q9QZD4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ercc4Q9QZD4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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