Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnt3Q9QZ47 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms