Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Phtf1Q9QZ09 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Phtf1Q9QZ09 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Phtf1Q9QZ09 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Phtf1Q9QZ09 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Phtf1Q9QZ09 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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