Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim44Q9QXA7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim44Q9QXA7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim44Q9QXA7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trim44Q9QXA7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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