Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gde1Q9JL56 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms