Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nectin1Q9JKF6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms