Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tuba8Q9JJZ2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tuba8Q9JJZ2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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