Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ccl28Q9JIL2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ccl28Q9JIL2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl28Q9JIL2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl28Q9JIL2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl28Q9JIL2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl28Q9JIL2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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