Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
OtofQ9ESF1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
OtofQ9ESF1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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