Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SgshQ9EQ08 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SgshQ9EQ08 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms