Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms