Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms