Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syde1Q9DBZ9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms