Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd9Q9D9M4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pdzd9Q9D9M4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pdzd9Q9D9M4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Pdzd9Q9D9M4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pdzd9Q9D9M4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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