Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c6Q9D8P7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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