Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cldn23Q9D7D7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn23Q9D7D7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms