Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop56Q9D6Z1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop56Q9D6Z1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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